Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms