Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms