Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
GCAP28676 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GCAP28676 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GCAP28676 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCAP28676 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCAP28676 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCAP28676 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms