Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APCP25054 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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APCP25054 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APCP25054 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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APCP25054 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCP25054 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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APCP25054 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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APCP25054 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APCP25054 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCP25054 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCP25054 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCP25054 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APCP25054 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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APCP25054 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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APCP25054 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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APCP25054 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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APCP25054 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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APCP25054 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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APCP25054 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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