Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms