Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERBB3P21860 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms