Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1P21675 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1P21675 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1P21675 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1P21675 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1P21675 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1P21675 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1P21675 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1P21675 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TAF1P21675 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1P21675 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1P21675 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms