Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD247P20963 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD247P20963 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD247P20963 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD247P20963 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD247P20963 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms