Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms