Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms