Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLP19338 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLP19338 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLP19338 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms