Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF3P18847 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF3P18847 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF3P18847 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF3P18847 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF3P18847 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF3P18847 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms