Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR1P18146 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms