Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms