Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms