Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A1P12074 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms