Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms