Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH3P11055 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH3P11055 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYH3P11055 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYH3P11055 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYH3P11055 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH3P11055 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH3P11055 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH3P11055 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms