Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4BP0C0L5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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