Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms