Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSF2P04141 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSF2P04141 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSF2P04141 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSF2P04141 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms