Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms