Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX6O95475 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX6O95475 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX6O95475 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms