Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG7O95352 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG7O95352 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG7O95352 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG7O95352 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG7O95352 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms