Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD4O95243 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD4O95243 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms