Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms