Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN5O75503 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN5O75503 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN5O75503 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN5O75503 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN5O75503 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN5O75503 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms