Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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