Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HOXC11O43248 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC11O43248 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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