Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APAF1O14727 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APAF1O14727 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APAF1O14727 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms