Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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