Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
B4DXG7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
B4DXG7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
B4DXG7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
B4DXG7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DXG7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DXG7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DXG7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DXG7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DXG7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DXG7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DXG7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DXG7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DXG7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DXG7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DXG7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DXG7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms