Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC169A6NNP5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC169A6NNP5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms