Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSDA5PKW4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms