Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms