Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAB39Q9Y376 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms