Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHDC2Q9Y2U9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms