Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms