Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms