Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms