Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA2Q9UL42 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA2Q9UL42 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms