Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms