Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHIC2Q9UKJ5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms