Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CROTQ9UKG9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms