Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms