Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA9Q9UGM1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms