Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms