Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms