Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms