Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms